Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Atp7a-202ENSMUST00000113557 4900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 1700021G15Rik-201ENSMUST00000217671 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc180J3QNE4 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc180J3QNE4 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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