Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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Ube3bQ9ES34 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Ube3bQ9ES34 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Ube3bQ9ES34 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ube3bQ9ES34 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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