Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm20743-202ENSMUST00000194322 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm11668-201ENSMUST00000119655 701 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm6410-201ENSMUST00000181337 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm4929-201ENSMUST00000182021 992 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm20879-201ENSMUST00000188719 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm29229-201ENSMUST00000188874 323 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 4933436H12Rik-203ENSMUST00000207818 1466 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm10251-202ENSMUST00000181786 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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