Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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