Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm42527-201ENSMUST00000198173 1480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 P2rx2-206ENSMUST00000200214 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trim35Q8C006 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trim35Q8C006 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trim35Q8C006 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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