Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Elavl2-203ENSMUST00000107109 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Elavl2-205ENSMUST00000107111 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm10224-201ENSMUST00000119496 615 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm13536-201ENSMUST00000132913 766 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm4651-201ENSMUST00000181738 1283 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Mir7659-201ENSMUST00000184079 58 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Igkv12-42-201ENSMUST00000198769 327 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 AC025913.1-202ENSMUST00000220385 824 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Snora61-201ENSMUST00000083015 130 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
CtifQ6PEE2 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms