Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 1700012A03Rik-201ENSMUST00000031778 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Eif3g-201ENSMUST00000004206 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Morn3-202ENSMUST00000045843 904 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Gm10080-201ENSMUST00000075585 438 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Arl14epl-201ENSMUST00000097580 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Dync2h1-202ENSMUST00000139115 2892 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm36325-201ENSMUST00000210487 2885 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 4930402H05Rik-201ENSMUST00000203115 2829 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 AC122937.3-201ENSMUST00000227906 1354 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Rasgef1c-201ENSMUST00000063444 3378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Zp2-201ENSMUST00000033207 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Tex24-201ENSMUST00000095375 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Chil1-208ENSMUST00000156873 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Hip1-210ENSMUST00000212301 1625 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Siglech-202ENSMUST00000094360 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Morc2b-201ENSMUST00000053896 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Rap1gds1-205ENSMUST00000196280 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Fbxo34-202ENSMUST00000095941 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Adam17-202ENSMUST00000101551 4469 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Hnrnpk-201ENSMUST00000043269 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Dcaf11-201ENSMUST00000072530 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Gm11353-201ENSMUST00000180940 627 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm4929-201ENSMUST00000182021 992 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm8957-201ENSMUST00000182082 1012 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Znf48Q3US17 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm31373-201ENSMUST00000194403 737 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm5550-201ENSMUST00000198658 1076 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Znf48Q3US17 Gm42786-201ENSMUST00000202357 280 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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