Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Ttc28-201ENSMUST00000040111 10780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Map3k7-204ENSMUST00000108184 5491 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Tbc1d14-201ENSMUST00000031094 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm28884-201ENSMUST00000190367 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Usp19Q3UJD6 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms