Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Trim71Q1PSW8 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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