Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms