Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc21bQ0HA38 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28234-201ENSMUST00000185657 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm29586-207ENSMUST00000189745 615 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms