Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm8814-201ENSMUST00000119072 535 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 E130120K24Rik-201ENSMUST00000129910 556 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm27941-201ENSMUST00000183418 142 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm10024-201ENSMUST00000075421 553 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Trim12a-202ENSMUST00000106837 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 D330041H03Rik-207ENSMUST00000181760 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Cdk2ap1-205ENSMUST00000196910 483 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Irx2P81066 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms