Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm11468-201ENSMUST00000152987 383 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm17359-201ENSMUST00000164216 778 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm26942-201ENSMUST00000182854 797 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Ckb-ps1-201ENSMUST00000199192 1127 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm45698-201ENSMUST00000208537 1135 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC134254.3-201ENSMUST00000223533 575 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Ldb2-207ENSMUST00000199534 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Tom1l1-203ENSMUST00000107868 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Fignl1-206ENSMUST00000171080 2844 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Zfp946-202ENSMUST00000120222 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Epn2-202ENSMUST00000108711 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Tnf-202ENSMUST00000167924 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Mlst8-202ENSMUST00000179163 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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LtbrP50284 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LtbrP50284 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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