Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rps3-205ENSMUST00000208532 489 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Blzf1-201ENSMUST00000027866 3948 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm8605-201ENSMUST00000221619 1370 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Aldh1l1-203ENSMUST00000130418 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ttc17-204ENSMUST00000111238 4590 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Magea2-201ENSMUST00000069477 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nemp1-201ENSMUST00000048099 6002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Snapc4-202ENSMUST00000114115 4368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fgr-201ENSMUST00000030693 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Acvr1-204ENSMUST00000112601 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm21129-201ENSMUST00000185932 2560 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29258-201ENSMUST00000186842 2564 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Setd5-203ENSMUST00000113157 6527 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ublcp1-201ENSMUST00000102795 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Mageb2-202ENSMUST00000201779 1551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Btnl10-203ENSMUST00000108818 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Arpc3-204ENSMUST00000111716 838 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm7645-201ENSMUST00000119008 788 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm17068-201ENSMUST00000163135 980 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ly6g6c-203ENSMUST00000174876 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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