Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
OtofQ9ESF1 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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