Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Rnft1Q9DCN7 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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