Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm6227-201ENSMUST00000205237 421 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm4513-201ENSMUST00000207881 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm4565-201ENSMUST00000208134 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Pqbp1-201ENSMUST00000033497 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Npm1-202ENSMUST00000093201 1192 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Tsnaxip1-203ENSMUST00000212566 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Riok3Q9DBU3 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms