Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Usp16Q99LG0 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp16Q99LG0 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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