Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Card11Q8CIS0 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Card11Q8CIS0 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Card11Q8CIS0 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms