Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Usp47Q8BY87 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp47Q8BY87 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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