Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 AC118006.3-201ENSMUST00000223948 1176 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Cldn17Q8BXA6 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms