Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Khdc1a-201ENSMUST00000088407 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Prkrip1-204ENSMUST00000151786 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Usp54Q8BL06 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Usp54Q8BL06 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Usp54Q8BL06 Gm38229-201ENSMUST00000191931 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm38121-201ENSMUST00000193213 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm38035-201ENSMUST00000194427 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm38350-201ENSMUST00000194789 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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