Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Arhgap21-213ENSMUST00000173194 6920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Crebbp-205ENSMUST00000205765 7749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ccdc18Q640L5 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Alg8-201ENSMUST00000098300 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ccdc18Q640L5 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
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