Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Dhcr7-201ENSMUST00000073878 2815 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gskip-201ENSMUST00000051934 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm44684-201ENSMUST00000205388 2926 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm33023-202ENSMUST00000212450 1571 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 CT009518.1-201ENSMUST00000224886 1571 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Mgl2-201ENSMUST00000041550 1586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Atp2c1-212ENSMUST00000176770 2781 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Cuta-202ENSMUST00000114935 597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Prss28-201ENSMUST00000015267 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 1700061E17Rik-201ENSMUST00000185439 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Apoc1-201ENSMUST00000045035 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Rhox12-201ENSMUST00000096453 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Habp2-206ENSMUST00000166049 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Ckap2l-201ENSMUST00000052708 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm18876-201ENSMUST00000219985 1849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Psen1-202ENSMUST00000101225 3023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Mkrn3Q60764 Myzap-204ENSMUST00000169573 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mkrn3Q60764 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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