Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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Usp19Q3UJD6 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Usp19Q3UJD6 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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