Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm43080-201ENSMUST00000199006 2643 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Q3U6N9 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Q3U6N9 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Q3U6N9 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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