Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Snx25-207ENSMUST00000170416 3067 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm36958-201ENSMUST00000192388 1875 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Rps19-ps3-201ENSMUST00000116174 426 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm13784-201ENSMUST00000119639 519 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm38059-201ENSMUST00000193746 1999 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Ces2c-201ENSMUST00000055052 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Myo15b-207ENSMUST00000167507 1785 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Polr3c-206ENSMUST00000154679 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 2700029L08Rik-201ENSMUST00000202895 1465 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Cdkl4-201ENSMUST00000086545 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Nasp-202ENSMUST00000030457 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Rbm43-206ENSMUST00000165313 1975 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 1600029O15Rik-202ENSMUST00000179787 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Casp14-201ENSMUST00000005488 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Fam117bQ3U3E2 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms