Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
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Ttc39dQ0VF76 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ttc39dQ0VF76 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Ttc39dQ0VF76 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms