Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SrprbP47758 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SrprbP47758 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms