Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Pcdhb15-201ENSMUST00000050034 2801 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm22268-201ENSMUST00000104009 131 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Glt8d2-202ENSMUST00000065815 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr319-201ENSMUST00000076965 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm7328-201ENSMUST00000211123 2225 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Eps15-202ENSMUST00000102729 5190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Runx1t1-202ENSMUST00000098256 3317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Polq-201ENSMUST00000054034 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Osbpl1a-202ENSMUST00000117361 2687 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Supt7l-201ENSMUST00000065388 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm18639-201ENSMUST00000210442 1769 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Atxn3-201ENSMUST00000021606 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Tfpi-206ENSMUST00000111718 2027 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm33111-202ENSMUST00000219954 3388 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Cep41-201ENSMUST00000031810 3447 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Fbxl2-201ENSMUST00000035090 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12202-201ENSMUST00000121196 811 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd9P28357 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
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