Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm25266-201ENSMUST00000158521 304 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Arhgef38-204ENSMUST00000161932 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44018-201ENSMUST00000204471 407 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12219-201ENSMUST00000119198 443 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12180-201ENSMUST00000120905 661 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 489 ms