Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TtrP07309 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TtrP07309 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TtrP07309 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms