Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Col12a1-201ENSMUST00000071750 11511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Edil3O35474 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms