Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Tssk4-203ENSMUST00000226497 1235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm16026-201ENSMUST00000094774 580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Olfr62-201ENSMUST00000102666 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Gm21977F6U3N7 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms