Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.2 ms