Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Mertk-201ENSMUST00000014505 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Dpp6-202ENSMUST00000101471 4491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prdm2A2A7B5 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms