Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC153864.1-201ENSMUST00000218482 523 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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Rnf4Q9QZS2 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Rnf4Q9QZS2 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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