Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 AC154482.1-201ENSMUST00000223248 2483 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnft1Q9DCN7 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms