Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atg3Q9CPX6 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Atg3Q9CPX6 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Atg3Q9CPX6 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
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