Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Apol11b-202ENSMUST00000180949 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Olfr449-201ENSMUST00000050729 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Srgap1-202ENSMUST00000081688 7787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Atp2a1-201ENSMUST00000032974 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PtprtQ99M80 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms