Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo3Q8C2S7 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 Cdh8-204ENSMUST00000142129 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 Gpbp1-202ENSMUST00000091236 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Amigo3Q8C2S7 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Amigo3Q8C2S7 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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