Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm44883-201ENSMUST00000206063 3258 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm8183-201ENSMUST00000183134 980 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usp54Q8BL06 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms