Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Puf60Q3UEB3 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Puf60Q3UEB3 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Puf60Q3UEB3 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms