Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms