Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gbx1P82976 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gbx1P82976 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gbx1P82976 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gbx1P82976 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Gbx1P82976 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Fam129a-205ENSMUST00000148810 6531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gbx1P82976 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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