Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Atp6v0a1-202ENSMUST00000092663 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Otx2P80206 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms