Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Trim40-203ENSMUST00000172711 1539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm17188-202ENSMUST00000165178 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 4933406F09Rik-202ENSMUST00000180508 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm5327-201ENSMUST00000182864 1009 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm29462-201ENSMUST00000191458 288 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm42977-201ENSMUST00000197497 144 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Sh3bp1P55194 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sh3bp1P55194 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sh3bp1P55194 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Sh3bp1P55194 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sh3bp1P55194 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sh3bp1P55194 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Sh3bp1P55194 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms