Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Vmn2r-ps87-201ENSMUST00000174393 876 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 5430427N15Rik-201ENSMUST00000200007 2393 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Sptan1P16546 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Lipa-202ENSMUST00000178114 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Ak7-201ENSMUST00000040876 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Zfp652os-201ENSMUST00000155531 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Sptan1P16546 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms