Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Mir6974-201ENSMUST00000184381 83 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
H2-Eb1P04230 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms