Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm23604-202ENSMUST00000198428 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prrt4B2RU40 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms